Незадолго до своей кончины о.Алексий передал своих духовных детей о.Сергию и тут же слег в постель.
Обычно в летнее время он уезжал на отдых в Верею, в свой домик. Предполагался и в текущем (1923) году его отъезд туда, но на этот раз он произошел как-то по-особенному.
Прежде всего Батюшка собрался неожиданно, как-то торопливо, да и прощание его было какое-то загадочное. Отслужив Божественную литургию, он всех причастил Св.Христовых Тайн и благословил каждого образком Св.Николая, говоря: «Благословляю вас нашим Хозяином, — так называл он Святителя, покровителя маросейского храма. — Я чувствую себя очень плохо, уезжаю, но скоро вернусь». Действительно, прошло всего лишь девять дней, и получили телеграмму о внезапной кончине Батюшки. Он умер 9 июня 1923 года.
По всему было видно, что Батюшка намеренно уезжал умирать в Верею, стремясь, между прочим, закончить там на свободе последнее свое завещание. Все бывшие при нем замечали, как он торопился писать его, отказываясь от прогулки на солнце, обычной в прежнее время. Когда его звали из комнаты на воздух, он говорил: «Нет, я здесь в тени посижу, там у меня мысли рассеиваются, не успею докончить». И тут же добавлял: «Я ведь затем и приехал, чтобы заняться этим, в Москве мне бы не дали».
Последние дни Батюшка вел себя так, как будто с ним что-то случилось, или он чего-то ожидал: говорил тихо, двигался медленно, как бы боясь нарушить внутренний мир свой, и казался каким-то просветленным. Последний вечер был весел и особенно ласков со всеми. Умер о.Алексий внезапно — от паралича сердца.
Как громом поразила всех неожиданная смерть дорогого Батюшки.
Сидят: Феодор (Поздеевский) - в центре; слева - архим.Варлаам (Ряшенцев); справа - Симеон (Холмогоров).Стоят: (слева направо) иеромонахи: Гурий (Степанов), Филипп (Гумилевский) и Герман (Ряшенцев). Московская духовная академия. 1909-1912 гг.
Тело почившего накануне погребения было перевезено из Вереи в Москву около 6 часов вечера. Гроб встретили: собравшееся в большом количестве духовенство, родные, сестры и братья маросейской общины и тысячная толпа народа, которую не могла вместить небольшая местная церковь Св.Николая. Чтобы дать возможность помолиться всем, служили две заупокойные всенощные: в храме — преосвященный Герман Волоколамский (см. на фото выше), и во дворе — Тихон, митрополит Уральский. Служба окончилась около 12 часов ночи. Все остальное время между богослужениями пели панихиды и происходило прощание с почившим. Утром в 10 часов началась Литургия, которую совершал епископ Феодор, настоятель Данилова монастыря (см. на фото выше), в сослужении 30 священников и 6 диаконов, а на отпевание, закончившееся в 4 часа, вышло около 80 человек духовенства. Тут же было прочитано посмертное завещание о.Алексия духовным чадам и сказано несколько надгробных речей. В 5 часов при пении пасхальных песнопений похоронная процессия двинулась на Лазарево кладбище, куда прибыл для встречи тела Батюшки Св.Патриарх Тихон, за несколько часов до этого освобожденный из заключения. Святейший отказался войти в кладбищенский храм, ставший в его отсутствие обновленческим, и облачался на паперти. Здесь, таким образом, произошло всенародное осуждение Главою Русской Православной Церкви нового раскола, причем осуждение немедленное, как только возможно было таковое сделать. Факт, достойный примечания!
Со всей Москвы собрался народ на это великое духовное торжество. С одной стороны, была большая скорбь о потере незаменимого пастыря, а с другой, всех охватила радость по случаю неожиданного освобождения Святейшего. «Прежде чем воскреснуть, нужно умереть». И о.Алексий как бы для того умер, чтобы Церкви дарована была эта радость. Он даже говорил некоторым: «Когда я умру — вам будет радость».
Епископ Арсений (Жадановский)